בניתוח ויטרקטומיה מסירים את הזגוגית (ויטראוס) שהוא הג'ל שממלא את חלל העין. בתחילת הניתוח מבצעים שלושה חתכים קטנים בדופן העין שדרכם מכניסים את המכשירים הדרושים לניתוח. את הזגוגית שמוציאים בזמן הניתוח מחליף נוזל צלול שמופרש מהעין. ניתוח ויטרקטומיה נעשה לרוב בהרדמה מקומית של אזור העין אך ניתן לעשותו גם בטשטוש ובהרדמה מלאה.
הסיבות השכיחות לניתוח כוללות דימום בזגוגית, ממברנה אפירטינלית, חור מקולרי והפרדות רשתית.
